Informations du cours

Présentation et application des principes FAIR pour la gestion des données dans un projet bioinformatique.

Les plateformes ARTbio, Migale, PlantBioinfoPF, l'Institut Pasteur Paris et l’Institut Français de Bioinformatique (IFB) organisent une formation à destination de bioinformaticiens, biologistes et médecins devant gérer des jeux de données omiques. La formation abordera les différents points fondamentaux (théoriques, pratiques, juridiques) en lien avec la politique nationale d’ouverture des données de la recherche et présentera sous forme de séances pratiques les ressources nationales accessibles à la communauté scientifique ainsi que les solutions proposées par l’IFB pour gérer les données d’un projet de recherche. La formation se déroulera en présentiel à Paris sur le campus de Sorbonne Université.

Objectifs pédagogiques

A la fin de cette formation, les participants connaîtront et pourront mettre en œuvre les principes de la science ouverte pour gérer leurs jeux de données dans un projet :

• Les principes fondamentaux de l’Open Data en biologie et santé, y compris dans ses aspects juridiques ;
• Les bonnes pratiques et outils de gestion des données d’un projet en bioinformatique, en lien avec les ressources de l’infrastructure IFB ;
• Le PGD : séances théoriques et pratiques de construction d’un PGD sur des exemples de jeux de données omiques ;
• Le choix des métadonnées : panorama des ressources existantes pour choisir des métadonnées et mise en pratique pour annoter des jeux de données omiques en vue de la publication des données dans une banque internationale ou un dataverse institutionnel.

Formateurs