Résumé de section
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L’ensemble de la formation reposera sur l’utilisation des ressources de calcul et environnements de travail de l’Institut Français de Bioinformatique.
Afin de nous prémunir d'éventuelles soucis techniques ou autres nous demandons à tous les participants d'installer en local sur leurs machines les logiciels, packages suivants :
- R 4.3.1
et des packages suivant :
FactoMineR >=2.9 factoextra >=1.0.7 ggpubr >=0.6.0 corrplot >=0.92 RGCCA >=3.0.3 ggplot2 >=3.4.4 data.table >=1.14.8 DT >=0.32 psych >=2.4.1 MOFA2 >=1.12.1 r.jive >=2.4 GGally >=2.2.1 NMF >=0.27 MOFAdata >=1.18.0 SNFtool >=2.3.1 pheatmap >=1.0.12 igraph >=1.4.2 mixOmics >=6.24.0 reshape2 >=1.4.4 compositions >=2.0-4 ecodist >=2.0.9 WGCNA >=1.72.1
- Cytoscape 3.9.1
Et les modules Cytoscape suivant :stringApp 2.0.0 yFiles Layout Algorithm 1.1.2 LegendCreator 1.1.6