Généralités

L’Institut Français de Bioinformatique organise en partenariat avec l'IDRIS et les plateformes PRABI-AMSB, BIOI2, CUBIC, RPBS et Bilille une 2ème édition de la formation intitulée: “AlphaFold et au-delà : Modélisation de la structure 3D des protéines avec des outils d’IA / AlphaFold & beyond: 3D Protein Structure Modeling with AI Tools”.

Cette formation aura lieue du mercredi 20 janvier à 14h au vendredi 22 janvier 2027 à 12h dans la salle de formation de l’IDRIS à Orsay, sur le campus de l’Université de  Paris-Saclay (voir plan d’accès et hébergements à proximité ici).

Important

La formation sera organisée autour d’un tronc commun sur la modélisation 3D de la structure d’un monomère et d’un complexe protéique, incluant d’éventuelles modifications post-traductionnelles.

 Plusieurs cas d’applications sont proposés à l’inscription à la formation. Ils seront dispensés si le nombre de participants intéressés est suffisant : 

• Use case 1 : Cribler des interactions protéiques . Mettre en oeuvre une analyse de type système appât/proie au sein d’un même protéome (ex: AlphaPullDown)

• Use case 2 : Cribler des interactions de ligands chimiques avec une protéine. Cribler une banque de données de ligands sur une protéine.

• Use case 3 : Échantillonnage massif des prédictions d’un complexe protéique. Générer des milliers de prédictions avec MassiveFold pour un même complexe protéique (dont anticorps-antigène) dans le but d’obtenir une prédiction de bonne qualité quand une exécution basique d’AlphaFold ne suffit pas.