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  • General

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  • Présentation de la formation

    Présentation de la formation  

    Cette formation, à destination de bioinformaticiens et biologistes, présente les principes FAIR de gestion de données dans un projet de bioinformatique ou de biologie. Elle aborde les différents points fondamentaux (théoriques, pratiques, juridiques) en lien avec la politique nationale d’ouverture des données de la recherche et présente sous forme de séances pratiques les ressources nationales accessibles à la communauté scientifique ainsi que les solutions proposées pour gérer les données d’un projet de recherche.  

    Objectifs pédagogiques

    A la fin de cette formation, les participants connaîtront et pourront mettre en œuvre les principes de la science ouverte pour gérer leurs jeux de données dans un projet :

    • Les principes fondamentaux de l’Open Data en biologie et santé, y compris dans ses aspects juridiques ;
    • Les bonnes pratiques et outils de gestion des données d’un projet en bioinformatique, en lien avec les ressources de l’infrastructure IFB ;
    • Le PGD : séances théoriques et pratiques de construction d’un PGD sur des exemples de jeux de données omiques ;
    • Le choix des métadonnées : panorama des ressources existantes pour choisir des métadonnées et mise en pratique pour annoter des jeux de données omiques en vue de la publication des données dans une banque internationale ou un dataverse institutionnel.

    Cette formation est organisée par la plateforme BiGEst et se déroulera sur 2 jours à l'IGBMC les 23 et 24 mars 2022 de 9h à 17h30.
    Langue : cette formation sera en français.
    Cette formation est gratuite, le repas de midi sera à votre charge.

    Date limite d’inscription : 06 mars 2022
    Nombre de participants acceptés : 12

  • Formateurs

    Laurent Bouri, Kirsley Chennen, Valérie Cognat, Arnaud Kress, Paulette Lieby, Julien Seiler, Bertrand Vernay

  • Prérequis

    Chaque participant doit venir équiper d'un ordinateur portable.

    Il devra également créer un compte sur OPIDOR : https://dmp.opidor.fr/

  • Programme et supports


     
    Module Titre Supports
    Module 1     
    		Introduction - Les données de la recherche
    		 module1.pdf & intro_au_PGD.pdf & module_1_avec_OPIDoRV3.0.pdf
    Module 2
    		 Bonnes pratiques - la vie des données pendant le projet              
    		module2.pdf & modele_radar.xls & modules_2-3_avec_OPIDoRV3.0.pdf
    Module 3
    		 Les métadonnées : standards et retours d'expérience
    		 module3.pdf & modules_2-3_avec_OPIDoRV3.0.pdf
    Module 4
    		 Partage et valorisation des données
    		 module4-1.pdf & module4-2.pdf & module_4_avec_OPIDoR.pdf