Lundi 17 novembre
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8h30-8h50
| Intro Cluster
| Gildas Le Corguillé
Julien Seiler | Slide
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| 9h00-10h15 | Intro Linux | Pauline François
Mathieu Genete
Elise Jacquemet
Claire Toffano-Nioche
| Slide (Jupyter)
Slide (commandes)
Slide (aide) |
| 10h15-10h45 | Pause café | | |
| 10h45-12h45 | Linux Arborescence | Pauline François
Mathieu Genete
Elise Jacquemet
Claire Toffano-Nioche | Slide (arborescence)
Slide (commandes de base)
Slide (manipulation de fichiers)
Bonus (GameShell)
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| 14h30-15h00 | Intro NGS | Claude Thermes
Morgane Thomas-Chollier | Slide
Vidéo synthétique (7min-Youtube) |
| 15h00-16h00 | Qualité des lectures | Claire Toffano-Nioche
Pauline François
Mathieu Genete
| Slide
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| 16h00-16h30 | Pause café | | |
| 16h30-17h45 | Mapping | Pauline François
Mathieu Genete
| Slide
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| 18h00-19h00 | Exposé d'ouverture: Long reads | Claude Thermes | Partie 1
Partie 2 |
| Mardi 18 novembre | | | |
| 8h30-10h15 | IGV | Morgane Thomas-Chollier
Sophie Lemoine
Jean-Pascal Meneboo
| IGV_documentation
IGV_practical
IGV_data |
| Mercredi 19 Novembre | | | |
| 8h30-10h15 | Intro R | Elodie Darbo
Elise Jacquemet
Mathieu Genete
Charlotte Berthelier | Slide
Données csv, tsv, xlsx
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| Jeudi 20 Novembre | | | |
| 10h45-12h05 | Manipulation de données
| Nadia Bessoltane
Pauline François
Claire Toffano-Nioche | Slide
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| 12h05-12h45 | Demo cluster | Gildas Le Corguillé
Julien Seiler
| TD |