Aperçu des sections

  • Généralités

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    https://tinyurl.com/plant-pheno-forma-2023

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  • Présentation de la formation

    Marqué

    Présentation de la formation
    Le but de cette formation est double :
    * diffuser auprès des Référents Données Opérationels (RDO) les bonnes pratiques pour une gestion FAIR des données de phénotypage de plantes
    * consolider et préparer la diffusion d'une formation modulaire adaptée à un maximum de besoins, du débutant qui souhaite partager des données standardisées dans Recherche Data Gouv, à l'utilisateur avancé qui souhaite faire de la sémantique ou utiliser des portails de données fédérés.
    La formation se déroulera sur 2 jours avec une alternance de présentations générales et techniques et d'ateliers pratiques.

    Objectifs pédagogiques
    A la fin de cette formation, les participants auront acquis des connaissances théoriques et pratiques sur :
    * la gestion de données de phénotypage de plantes respectant les principes FAIR
    * l'utilisation des standards de (méta)données de la communauté plante
    * l'écosystème des systèmes d’informations utilisés par les unités INRAE et au-delà
    Ils auront également standardisé un jeu de données au format MIAPPE et identifié des pistes d'amélioration pour la gestion de leus données.

    Cette formation est organisée par la plateforme PlantBioinfoPF.
    Logo PlantBioinfoPF

  • Informations pratiques

    La formation aura lieu en présentiel à Paris, à l'hôtel Provinces Opéra
    Adresse : 36, rue de l’Echiquier, 75010 Paris (cf. plan d'accès).

    Accueil et déjeuner : jeudi 15 juin 2023 à partir de 12h
    Début de la formation : jeudi 15 juin 2023 à 13h30
    Fin de la formation : vendredi 16 juin 2023 à 16h30

    La formation est financée par Phenome Emphasis.
    L'URGI prend en charge l'organisation et les paiements.

  • Prérequis

    Chaque participant doit venir équipé d'un ordinateur portable.

    Il vous est fortement conseillé d'apporter l'un de vos jeux de données de phénotypage pour la partie pratique, qui consistera à standardiser votre dataset.

  • Equipe pédagogique

    Formateurs
    Célia Michotey
    Cyril Pommier

    Orateur invité
    Isabelle Alic

  • Programme et supports

    Horaire Titre  Orateur Support
     JOUR 1
    		     
     12h - 13h30
    		  Accueil et déjeuner
    		  --
     13h30 - 14h30 
    		 Introduction
    		  Célia Michotey
     Cyril Pommier    		 Module0.1_IntroFormation.pptx
     Module0.2-PlantBioinfoPF-nutshell.pptx
     14h30 - 16h
    		  Module 1 : Données FAIR  Célia Michotey
    		 Module1_FAIR_Data.pptx
     16h - 16h30
    		  Pause  - -
     16h30 - 17h Module 2 : Environnement et outils de travail
    		 Cyril Pommier Module2_EnvTravail.pptx
     17h - 18h30  Module 3 : Standards de (méta)données  Cyril Pommier Module3.1_metadata.pptx
     Module3.2_MIAPPE.pptx
     20h
    		  Diner  - -
     JOUR 2
    		    
     9h - 10h30
    		  Module 4 : TP MIAPPE
    		 Célia Michotey
     Cyril Pommier
    		 Module4_HandsOn.pptx
     10h30 - 11h
    		  Pause  - -
     11h - 12h30
    		  Module 5 : Partage & Ecosystème SI
    		  Célia Michotey
    		 Module5.1_PartageValo.pptx
     Module5.2_EcosystemeSI.pptx
     12h30 - 13h30
    		  Déjeuner  - -
     13h30 - 14h
    		  Module 6 : Présentation de SI - FAIDARE  Cyril Pommier Module6.2_FAIDARE-overview.pptx
     14h - 15h15
    		  Module 6 : Présentation de SI - OpenSilex
    		  Isabelle Alic
    		 GDrive  ou ppt
     15h15 - 15h45  Module 6 : Présentation de SI - RDG MIAPPE  Cyril Pommier Module6.3_RDG-MIAPPE.pptx
     15h45 - 16h  Pause  - -
     16h - 16h30
    		  Bilan et Conclusions  Célia Michotey
     Cyril Pommier
    		 -

    Ressources
    Pendant la formation, écrivez vos questions et remarques sur le slido dédié : slido.com, code #2847487
    Nous utiliserons également les outils d'animation suivants :