Topic outline

  • Présentation

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    Présentation et application des principes FAIR pour la gestion des données de recherche en sciences de la vie

    Les plateformes ARTbio, Migale, PlantBioinfoPF, l'Institut Pasteur Paris et l’Institut Français de Bioinformatique (IFB) organisent une formation à destination de bioinformaticiens, biologistes et médecins souhaitant mettre en oeuvre les principes "FAIR" (Facile à trouver, Accessible, Interopérable, Réutilisable) pour la gestion de leur données de recherche au cours d'un projet de bioinformatique. La formation abordera les différents points fondamentaux (théoriques, pratiques, juridiques) en lien avec la politique nationale d’ouverture des données de la recherche et présentera sous forme de séances pratiques les ressources nationales accessibles à la communauté scientifique ainsi que les solutions proposées par l’IFB pour gérer les données d’un projet de recherche. 

    La formation se déroulera en présentiel à Paris, les inscriptions sont closes.

  • Informations pratiques

    Horaires : mardi 22 et mercredi 23 mars 2022 - de 9h30 à 17h30

    Adresse et condition d’accès : 

    Sorbonne Université - Campus Pierre et Marie Curie

    Salle N°102 de l’Atrium (1er étage)

    4 place Jussieu, Paris 5ème

    Plan accès Jussieu FAIR data édition francilienne

    Accès par métro Jussieu (lignes 7, 10) ou 

    par bus n°67, 89 (côté Jussieu) ; n°63, 89 (côté quai Saint Bernard)

    Repas de midi sur place : buffet pris en charge de l’IFB


  • Formateurs

    - ARTbio : Christophe Antoniewski, Naïra Naouar et Léa Bellenger (helper)
    - IFB : Hélène Chiapello, Thomas Denecker, Frédéric de Lamotte
    - Institut Pasteur Paris : Anne-Caroline Delétoille, Fanny Sébire et Lucie Lamothe (helper)
    - Migale : Valentin Loux, Cédric Midoux
    - PlantBioinfoPF : Célia Michotey, Cyril Pommier 

  • Prérequis

    Nous demandons à chaque participant (formateur et apprenant) qui n’en dispose pas déjà de se créer un compte personnel sur Opidor  pour vous permettre de l’utiliser pendant la formation. Opidor est un outil de rédaction et partage de Plans de Gestion de Données (PGD).

    Nous vous demandons de le faire quelques jours avant le démarrage du cours car il se peut que la validation du compte ne soit pas immédiate. Il est recommandé d'utiliser une adresse mail institutionnelle plutôt qu'une adresse mail personnelle. 



  • Programme et supports


    Module JourHoraire Contenu Lien vers les Supports
    Module 1 : Introduction22 mars matin  9:30-12:30 Introduction - Crise de reproductibilité - Ves le FAIR - Cycle de vie des données - Plan de Gestion de Données  Module 1
    Module 2 : Pratiques d'hygiène numérique 22 mars après-midi 13:30-17:30 Les données le long d'un projet - Sécurité - Traçabilté & Réutilisation - Outils et Solutions  Module 2
    Module 3 : Métadonnées 23 mars matin 9:30-12:30 Introduction - Standards de Métadonnées en Sciences de la Vie - Retours d'expérience sur la soumission dans les banques internationales Module 3
    Module 4 : Partage et valorisation des données 23 mars après-midi 13:30-17:30 Introduction - Cadre juridique - Partage et valorisation - Quizz final  Module 4


  • Ressources pédagogiques

    Tests, quizz, liens utiles pendant la formation