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Ecole de Bioinformatique Aviesan - IFB - Inserm "Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit" édition 2024

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Supports pédagogiques RNA bulk

Completion requirements
    • 1_Bio-informatique1_Bio-informatique
      • EBAII_N1_2024_RNAseq_Bioinfo.pdfEBAII_N1_2024_RNAseq_Bioinfo.pdf
      • intro_bioinfo_tp.htmlintro_bioinfo_tp.html
      • runme.ipynbrunme.ipynb
    • 2_Bio-statistique2_Bio-statistique
      • data.zipdata.zip
      • RNASeq_DEA.rRNASeq_DEA.r
      • RNASeq_differential_analysis.pdfRNASeq_differential_analysis.pdf
    • 3_Analyses_d_enrichissement3_Analyses_d_enrichissement
      • tablestables
        • KOvsWT.complete.txtKOvsWT.complete.txt
      • Gene_Set_Analysis.pdfGene_Set_Analysis.pdf
      • GSEA_TP.htmlGSEA_TP.html
      • GSEA_TP.jsonGSEA_TP.json
      • GSEA_TP.RGSEA_TP.R
    • 4_Assemblage_de_novo4_Assemblage_de_novo
      • RNASeq_denovo.pdfRNASeq_denovo.pdf
    • 5_Scripting_Workflow5_Scripting_Workflow
      • RNAseq_Workflow_et_Conclusion.pdfRNAseq_Workflow_et_Conclusion.pdf
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