| 09h00-09h30 | Gestion de pipelines (snakemake) | Claire Toffano-Nioche | workflow.pdf |
| 09h30-10h30 | TP 4 - Ecriture d’un workflow Snakemake | Claire Toffano-Nioche & Thomas Denecker | workflow.pdf
workflow_bonus.pdf
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| 10h30-11h00 | Pause | | |
| 11h00-12h00 | Traçabilité et partage (notebook)
| Céline Hernandez
| notebook.pdf |
| 12h00-13h00 | TP 5 - Markdown
| Céline Hernandez & Thomas Denecker
| notebook.pdf |
| 12h30-13h30 | Repas | | |
| 13h30-14h30 | Les usages sur un cluster HPC (IFB Core Cluster) : Conda, Singularity
| Gildas Le Corguillé & Julien Seiler
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| 14h30-15h30 | TP 6 - Déploiement d’un workflow sur l’IFB Core Cluster
| Gildas Le Corguillé & Julien Seiler
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| 15h30-16h00 | Pause | | |
| 16h00-17h00 | Exposer son projet | Thomas Denecker & Céline Hernandez | sharing.pdf
conclusion.pdf
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| 17h00-17h30 | Conclusion | Thomas Denecker & Céline Hernandez |