Lundi 18 novembre
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8h30-8h50
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Intro Cluster
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Gildas Le Corguillé
Julien Seiler |
Slide
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| 9h00-10h15 |
Intro Linux |
Pauline François
Mathieu Genete
Elise Jacquemet
Claire Toffano-Nioche
| Slide (commandes)
Slide (aide)
Bonus (GameShell) |
| 10h15-10h45 |
Pause café |
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| 10h45-12h45 |
Linux Arborescence |
Pauline François
Mathieu Genete
Elise Jacquemet
Claire Toffano-Nioche |
Slide (arborescence)
Slide (commandes de base)
Slide (manipulation de fichiers) |
| 14h30-15h00 |
Intro NGS |
Claude Thermes
Morgane Thomas-Chollier |
Slide
Vidéo synthétique (7min-Youtube) |
| 15h00-16h00 |
Qualité des lectures |
Emilie Drouineau
Pauline François
Mathieu Genete
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Slide
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| 16h00-16h30 |
Pause café |
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| 16h30-17h45 |
Mapping |
Emilie Drouineau
Pauline François
Mathieu Genete
Claire Toffano-Nioche
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Slide
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| 18h00-19h00 |
Exposé d'ouverture: Long reads |
Claude Thermes |
Slide |
| Mardi 19 novembre |
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| 8h30-10h15 |
IGV |
Sarah Farhat
Bastien Job
Jean-Pascal Meneboo
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IGV_documentation
IGV_practical
IGV_data |
| Mercredi 20 Novembre |
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| 8h30-10h15 |
Intro R |
Elodie Darbo
Elise Jacquemet
Olivier Kirsh
Audrey Onfroy
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Slide
Données csv, tsv, xlsx
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| Jeudi 21 Novembre |
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| 10h45-11h15 |
Demo cluster |
Gildas Le Corguillé
Julien Seiler |
Slide
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| 11h15-12h45 |
Manipulation de données |
Nadia Bessoltane
Pauline François
Claire Toffano-Nioche
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TD |