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Ecole de Bioinformatique Aviesan - IFB - Inserm "Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit" édition 2023

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Practice_SARTools

Completion requirements

Analyse différentielle : exercices pratiques avec SARTools

  • Script RNASeq_DEA.r avec le paramétrage et étapes pour l'analyse différentielle
  • Fichier target.txt résumant le design experimental
  • dossier raw avec des tableau de comptes obtenus en sortie du pipeline bioinfo
    • raw raw
      • KO1_feature.out KO1_feature.out
      • KO2_feature.out KO2_feature.out
      • KO3_feature.out KO3_feature.out
      • WT1_feature.out WT1_feature.out
      • WT2_feature.out WT2_feature.out
      • WT3_feature.out WT3_feature.out
    • RNASeq_DEA.r RNASeq_DEA.r
    • target.txt target.txt
◄ 02 - Analyse différentielle
03 - Analyses d'enrichissement ►

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EBAII Niveau 1 2023
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