Résumé de section
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Programme de l'atelier scRNA-seq
Analyses primaires Technologies, qualité et alignement
Visualisation IGV
Construction de la matrice de comptageAnalyses secondaires Préparation de la matrice de comptage
Normalisation et visualisation
Analyses des gènes et annotation des types cellulairesPour aller plus loin Intégration de données
Inférence de trajectoireConclusion
Ressources techniques (JupyterHub, RStudio, R, Rmarkdown)
Description d'un objet Seurat
Équipe :
Thibault Dayris
Émilie Drouineau
Bastien Job
Nathalie Lehmann
Sophie Lemoine
Eulalie Liorzou
Rémi Montagne
Audrey Onfroy
Morgane Thomas-Chollier-
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- Normalisation et scaling de la matrice de comptage
- Réduction de dimensions
- Visualisation
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- Analyses d'expression différentielle
- Analyses d'enrichissement en signatures
- Annotation des types cellulaires
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Les étudiants doiventMarquer comme terminé
Ce document présente brièvement des notions sommaires de l' "après", du point de vue :
- des analyses
- des technologies / applications techniques
3.7 Mo · Déposé le 9 nov. 23, 12:11 -
Les étudiants doiventMarquer comme terminé
Autres documents
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Ce PDF détaille les éléments principaux de la structure d'un objet Seurat (v4)
- sous forme textuelle
- sous forme graphique
669.3 Ko · Déposé le 8 nov. 23, 23:59 -
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2.7 Mo · Déposé le 7 nov. 23, 11:38
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