Ecole de Bioinformatique Aviesan - IFB - Inserm "Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit" édition 2023

Analyses d'enrichissement

• Script TP_GSEA_TP.R avec le paramétrage et étapes pour faire :
  • homogénéisation de l'annotation des gènes pour être compatible avec les bases de données de signatures (gene sets)
  • Over Representation Analysis (ORA)
  • Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)

• Fichier KOvsWT.complete.txt, issu du TP "Expression Différentielle"