Institut Français de Bioinformatique - Les formations
Skip to main content
IFB formation
  • Cours
    Tous les cours Recherche de cours
  • English ‎(en)‎
    English ‎(en)‎ Français ‎(fr)‎
You are currently using guest access (Log in)

Ecole de Bioinformatique Aviesan - IFB - Inserm "Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit" édition 2023

  1. Home
  2. Courses
  3. Formations analyse de données de séquençage haut d...
  4. Ecole de Bioinformatique Aviesan - IFB - Inserm (E...
  5. Niveau 1 débutant
  6. EBAII Niveau 1 2023
  7. Atelier scRNA-seq
  8. Metadatas atelier scRNA-seq

Metadatas atelier scRNA-seq

    • 01_Technologies_QC_Mapping.json01_Technologies_QC_Mapping.json
    • 02_IGV.json02_IGV.json
    • CellAnnotation.jsonCellAnnotation.json
    • DEA.metadata.jsonDEA.metadata.json
    • GSEA.metadata.jsonGSEA.metadata.json
    • Introduction Rmardown.jsonIntroduction Rmardown.json
    • introR_metadata.jsonintroR_metadata.json
    • Trajectory and RNA velocity.jsonTrajectory and RNA velocity.json
◄ Description de l'objet Seurat
Utilisation de JupyterHub ►
Skip Navigation
Navigation
  • Home

    • Site pages

      • My courses

      • Tags

      • ForumAnnonces du site

    • My courses

    • Courses

      • Formations analyse de données de séquençage haut d...

        • Ecole de Bioinformatique Aviesan - IFB - Inserm (E...

          • Niveau 2 intermédiaire

          • Niveau 1 débutant

            • EBAII Niv 1 2025

            • EBAII Niv 1 2024

            • EBAII Niveau 1 2023

              • General

              • Cours communs

              • Visualisation

              • Atelier ChIP

              • Atelier RNA

              • Atelier Variants

              • Atelier scRNA-seq

                • PageRessources techniques

                • PageLiens utiles

                • PageDes reads à la matrice de comptage

                • PagePréparation de la matrice de comptages

                • PageNormalisation et visualisation

                • PageAnalyse des gènes, annotation des types cellulaires

                • PageIntégration de données

                • FileInférence de trajectoire et RNA velocity

                • FileAnalyses single cell - Beyond

                • FileRapport CellRanger #1

                • FileRapport CellRanger #2

                • FileRapport CellRanger #3

                • FileDescription de l'objet Seurat

                • FolderMetadatas atelier scRNA-seq

                • FileUtilisation de JupyterHub

                • FileCours- Introduction à R avec Rstudio

                • FileCours- Introduction à Rmd

                • FileTP- Basic analysis (R)

                • FileTP- Basic analysis (Rmd)

                • FileTP- Basic analysis (html)

                • FileCours- Technologies QC Mapping (Morgane Thomas-Cho...

                • FileCours- IGV (Sophie Lemoine)

                • FileCours- Construction de la matrice de comptage (Nat...

                • FileCours- Preprocessing de la matrice de comptage (Ba...

                • FileTP- Preprocessing (1/2)

                • FileTP- Preprocessing (2/2)

                • FileCours- Normalisation et scaling (Nathalie Lehmann)

                • FileTP- Normalisation et scaling des données de comptage

                • FileCours- Visualisation, réduction de dimensions et c...

                • FileTP- Réduction de dimensions et visualisation (HTML)

                • FileTP- Réduction de dimensions et visualisation (RMD)

                • FileCours- Régression de covariables (Bastien Job)

                • FileCours- Differential Expression Analysis (DEA)

                • FileTP- DEA single-cell

                • FileCours- Annotation des cellules

                • FileTP- Annotation des cellules (HTML)

                • FileTP- Annotation des cellules (RMD)

                • FileGene Set Enrichment Analysis (GSEA)

                • FileTP- GSEA single-cell

                • FileCours- Intégration de données

                • FileTP- Intégration de données (HTML)

                • FileTP- Intégration de données (RMD)

          • Assemblage & Annotation

      • Formations IFB sur le thème du FAIR

      • Formations Bioinformatique Intégrative

      • Single-Cell Workshops

      • Omics analysis

      • E-formation

      • Pratiques pédagogiques

      • Artificial Intelligence

You are currently using guest access (Log in)
EBAII Niveau 1 2023
  • Cours
    • Tous les cours
    • Recherche de cours
  • English ‎(en)‎
    • English ‎(en)‎
    • Français ‎(fr)‎
Data retention summary
Get the mobile app