Pre-processing - Bastien Job


TP Partie 1


  • Chargement d'une matrice brute
  • Elimination des droplets vides
  • Estimation et suppression de l'ARN ambient
TP partie 2



  • Métriques de counts (nCount, nFeature)
  • Métriques techniques et biologiques (%mito, %ribo, %stress)
  • Estimation des phases du cycle cellulaire
  • Identification des doublets
  • Filtrage des features et des cellules

Last modified: Thursday, 9 November 2023, 12:25 PM