Cours Analyse d'expression différentielle - Thibault Dayris
Differential Expression Analysis (DEA)


TP DEA (version RMD)

 Recherchez des gènes différentiellement exprimés, selon votre design expérimental

Cours Annotation des types cellulaires - Eulalie Liorzou


TP Annotation des types cellulaires (version RMD ou version HTML)

  • Analyses d'expression différentielle puis annotation manuelle des clusters
  • Utilisation d'une base de données (annotation automatique)


Cours - Thibault Dayris
GSEA (Gene Set Enrichment Analysis)

TP GSEA (version RMD)

  • Utilisation de la liste des gènes différentiellement exprimés
  • Interrogation de bases de données de signatures (gene sets)

Identifiez l'activité de vos groupes de gènes : par cellules ou à partir d'un ensemble de gènes d'intérêt